Application of nearest neighbour search techniques to peptide identification from mass spectrometry

Ulate-Cárdenas, José de Jesús

2018

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Proyecto de Graduación (Maestría en Ingeniería en Computación) Instituto Tecnológico de Costa Rica, Escuela de Ingeniería en Computación, 2018

We explored if the application of Nearest Neighbour Search thecniques to the de novo sequence of amino acids from Tandem Mass Spectrometry will provide better performance and accuracy. We present an indexation strategy that allows a posterior interpretation of the spectral data using concepts of Topology. We also offer an analysis of the execution time and space needed for both strategies.

Técnicas; Identificación; Topología; Análisis; Tiempo;